ハードウェア、ソフトウェア、データベース、ネットワークの中に3問しか出題しないですか？午後問題の選択についてよく理解できてないです。
教えていただけないでしょうか。

今回の試験まではそちらの認識で正しいです。
ただし、次回以降は変更となりますので、↓の公式に載っている表を見るのが分かり易いかと。

プレス発表  基本情報技術者試験における出題を見直し
～ プログラミング能力・理数能力等を重視 ～
https://www.ipa.go.jp/about/press/20190124.html