https://www.fe-siken.com/kakomon/01_aki/pm01.html
設問２で「A社FWでは，開発室のネットワークだけから開発サーバにHTTP over TLS(以下，HTTPSという)又はSSHでアクセスできるように通信を制限している。」のルールは考慮されないのでしょうか。

シンクライアントから仮想マシンを通して開発PCをいじることで開発サーバにアクセスしているので、結局開発室のネットワークから開発サーバに接続していることになってます。何も問題ありません。VPNってそういう技術なので。